"ни единого разрыва" (с) Антон Уральский
Все утро коннектился/дисконектился, читал/писал, стирал, читал и пр. - ошибка не вылезла ни разу.
Причем если читаю конфигуратором, то данные приходит одним пакетом -15,18,6 байт, если команды шлю из терминала то приходят, как и раньше, несколькими пакетами по произвольному количеству байт.
все оказывается проще - программа пользователя с 0х0000 начинается, загрузчик в старших адресах сидит: http://microsin.net/programming/avr/bootloaders.html
так что надо просто попробовать лить хекс avrdude
